Ostatnia aktualizacja 2 sierpnia 2019 r
Chcielibyśmy podzielić się niektórymi z wielu zasobów, które nasi klienci uznali za przydatne do planowania projektów optogenetycznych. Jeśli znasz więcej zasobów, które powinniśmy uwzględnić, opublikuj komentarze — będziemy regularnie aktualizować tę listę.
Zaczynając od podstaw
Dla neuronaukowców Centrum Zasobów Optogenetycznych Karla Deisserotha jest prawdopodobnie najlepszym pierwszym przystankiem podczas planowania eksperymentu. Laboratorium Deisseroth dostarcza kasety DNA i wektory związane z optogenetyką społeczności badaczy zajmujących się optogenetyką, a także szkolenia i warsztaty z optogenetyki in vivo na kampusie Uniwersytetu Stanforda.
Kalkulator tłumienia mocy światła w stosunku do odległości dla tkanki mózgowej,
- Bazy danych chromoforów, sekwencji DNA i wektorów,
- Informacje na temat żądania wielu wirusów i DNA dostarczonych przez D-lab innym badaczom.
- Linki do protokołów dla wielu metod opartych na optogenetyce.
Mapowanie obwodów neuronowych
Artykuł Karla Deisserotha Cell z 2016 r. służy zarówno jako wstęp do mapowania obwodów neuronowych za pomocą optogenetyki, jak i przegląd wielu przełączników optogenetycznych dostępnych do tego zadania.
Znalezienie najlepszego przełącznika
Jeśli szukasz odpowiedniego przełącznika optogenetycznego dla swojego projektu, witryna internetowa OptoBase zapewnia wyselekcjonowane bazy danych technik optogenetycznych, ale prawdziwa wartość tkwi w indeksowaniu, oznaczaniu i narzędziach online, które zespół BIOSS stworzył w celu przyspieszenia wyszukiwania. Na przykład w wyszukiwaniu publikacji filtry takie jak „multichromatyczny” zwracają tylko artykuły, które łączą wiele przełączników optogenetycznych w jednym systemie optogenetycznym, a „Wyklucz tło” pozwala wykluczyć podstawowe badania nad fotoreceptorami.
Narzędzie OptoBase „Find the Application” jest selektorem publikacji pozwalającym odhaczyć zastosowania optogenetyczne (np. wspominając o nich w sekcji dyskusji. Publikacje są oznaczane i aktualizowane co tydzień. Optobase to wspólny projekt BIOSS Center for Biological Signal Studies.
Zapobieganie fototoksyczności podczas eksperymentów in vitro
Fototoksyczność stwarza ryzyko wprowadzenia artefaktów lub śmierci komórek zarówno w eksperymentach in vitro, jak i in vivo, zwłaszcza gdy długość fali oświetlenia jest mniejsza niż 500 nm. W przypadku eksperymentów in vitro Káradóttir et. glin. stwierdzili , że staranny dobór składników pożywki hodowlanej może zapobiec występowaniu wielu problemów w hodowlach komórek nerwowych. W szczególności usunięcie ryboflawiny, tyroksyny i trijodo-1-tyroniny oraz włączenie dodatkowych przeciwutleniaczy znacznie zwiększa przeżywalność komórek.
Te media i dodatki są teraz dostępne w Cell Guidance .
Optogenetyka nieneuronalna
W przypadku optogenetyki nieneuronalnej EMBL udostępnił w Internecie krótki kurs wprowadzający .
Modele transgeniczne — gotowe do użycia
Podczas gdy wiele firm dostarcza szczepy myszy i szczurów gotowe do transgenicznej manipulacji w celu wprowadzenia przełączników optogenetycznych, Jackson Laboratory dostarcza wiele szczepów myszy transgenicznych już wyrażających rodopsynę kanałową (CHR2), archaerhodopsynę (Arch) i halorodopsynę (NpHR).
Gotowe systemy in vitro i bezprzewodowe systemy optogenetyczne in vivo
Amuza dostarcza systemy bezprzewodowe Teleopto do optogenetyki in vivo na myszach i szczurach, a także matryce LED do optogenetyki in vitro na płytkach hodowlanych.
Bezprzewodowy system Teleopto składa się z odłączanej, ładowalnej głowicy (odbiornika) i światłowodowych implantów LED, które razem ważą zaledwie 1,3 grama. Nasze zestawy startowe to gotowe rozwiązania do pierwszego eksperymentu, w tym odbiorniki, implanty LED, pilot zdalnego sterowania, ładowarka i adaptery stereotaktyczne.
Tablice Teleopto LED są zwykle przeznaczone do oświetlania 96-dołkowych płytek wewnątrz inkubatorów, ale można je dostosować do wielu różnych rozmiarów i konfiguracji dołków.
Oba systemy są dostępne w kolorach z całego spektrum, w tym UV, fioletowym, niebieskim, żółtym, zielonym, czerwonym, dalekiej czerwieni i IR. Dostępne są również opcje wielokolorowe. Odwiedź witrynę Amuzy, aby uzyskać więcej informacji:
- Teleopto Bezprzewodowa Optogenetyka
- Optogenetyka in vitro
